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QNX logra un filesystem de alto rendimiento sin sacrificar fiabilidad. Mientras la mayoría de los datos se almacena en el caché y son escritos después de un retraso corto, los datos críticos del filesystem se escriben inmediatamente. Las actualizaciones de los directorios, inodes, bloques extends, y de los bitmap se envían forzosamente al disco para asegurar que la estructura del filesystem en el disco nunca sea incoherente.